Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms