Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1aQ62266 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms