Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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