Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sox17Q61473 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox17Q61473 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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