Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde3bQ61409 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms