Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2bQ61313 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms