Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamb3Q61087 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms