Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf1Q61069 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf1Q61069 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Usf1Q61069 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf1Q61069 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Usf1Q61069 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usf1Q61069 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usf1Q61069 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Usf1Q61069 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Usf1Q61069 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf1Q61069 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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