Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms