Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf3Q60765 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms