Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms