Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp78Q5U406 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp78Q5U406 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms