Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tns3Q5SSZ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms