Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap44Q5SSM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms