Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AbrQ5SSL4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms