Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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