Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms