Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf3Q5HZG4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms