Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam208bQ5DTT3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam208bQ5DTT3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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