Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms