Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdp2Q504M2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdp2Q504M2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms