Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xirp2Q4U4S6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Xirp2Q4U4S6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Xirp2Q4U4S6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms