Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox3aQ4TU90 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3aQ4TU90 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms