Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snhg11Q4G0K9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snhg11Q4G0K9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms