Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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