Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm906Q3V0M1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms