Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms