Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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