Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms