Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms