Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms