Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms