Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap1Q3UUV5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms