Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm10Q3UTQ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm10Q3UTQ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms