Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acsf3Q3URE1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acsf3Q3URE1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms