Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rbm20Q3UQS8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rbm20Q3UQS8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rbm20Q3UQS8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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