Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpr55Q3UJF0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gpr55Q3UJF0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms