Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc34Q3UI66 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms