Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms