Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrp36Q3UFY0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms