Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zyg11bQ3UFS0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms