Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U7U4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms