Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CenplQ3U3S3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms