Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms