Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms