Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms