Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edem3Q2HXL6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms