Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms