Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc7a1Q09143 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms