Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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